Html로 Excel 파일인척 다운로드할 때 크롬이나 기타 브라우저에서는 뭘로 하던 다운로드를 받은 후 열게 되기 때문에 문제가 없으나 IE는 바로 열거나 다운로드 중에 선택할 수 있다. 

content-type을 "application/vnd.ms-excel"로 했더니 바로 열릴때도 있지만 파일이 열리지 않을때도 많았다. 그래서 "application/octet-stream"로 바꿔주었더니 문제가 사라졌다.

참고: https://crowelee.wordpress.com/2006/05/14/http-header-and-excel-file-type/